不是刀剑的时代，新选组的专精于近战的剑士已经够多了，没有再扩充的必要。

于是乎，负责近战的一、二、三、四、五番队，仅仅只是补充先前的战损，并未展开进一步的扩编。

新增的四千兵力基本都分配进火枪队、火炮、骑兵、负责传令与谍报活动的九番队，以及都察局、总务司等后勤部门。

鉴于火枪队的兵力规模已膨胀至一个惊人的数字，青登又新设了两支崭新的火枪部队：十二番队与十三番队！

随着新部队的建立，青登对新选组的人事编制展开大刀阔斧的调整。

原六番队副队长相马主计调任为十二番队队长。

原八番队副队长吉村贯一郎调任为十三番队队长。

原三番队三席大石锹次郎调任为八番队副队长。

此外，提拔浅野薰、川村隼人等潜力十足的新人，命他们分别担任新部队的副队长。

现如今，新选组的组织架构如下——

【都察局】（宪兵队）

局长：近藤勇。

局长助勤：武田观柳斋。

目付500人。

【总务司】（主理行政工作）

总长：山南敬助。

总长助勤：伊东甲子太郎。

支配200人。

【财务室】（主理财务工作）

室长：艾洛蒂·昂古莱姆。

室长助勤：河合耆三郎。

勘定120人。

【精炼寮】（主理武器锻造与修理）

精炼头：北原春太郎。

铁匠250人。

【普请处】（主理野战工程、土木作业）

普清头：东云夏次郎。

手传150人。

【医疗方】（主理医疗事务）

医疗头：南条秋三郎。

医护人员100人。

中央机关与后勤部门，合计1320人。

接着是战斗部队，即拔刀队——

副长：土方岁三。

副长助勤：尾形俊太郎。

【一番队】（精锐步兵队）：

队长：橘司（冲田总司）。

副队长：岛田魁。

兵力300。

【二番队】（精锐步兵队）：

队长：永仓新八。

副队长：中岛登。

兵力250。

【三番队】（精锐步兵队）：

队长：斋藤一。

副队长：中泽贞只。

兵力250。

【四番队】（步兵队）：

队长：芹泽鸭。

副队长：谷三十郎。

兵力550。

【五番队】（步兵队）：

队长：新见锦

副队长：谷万太郎。

兵力450。

【六番队】（火枪队）：

队长：井上源三郎。

副队长：安藤早太郎。

兵力1150。

【七番队】（骑兵队）：

队长：橘佐那子（千叶佐那子）。

副队长：中泽琴。

兵力600。

【八番队】（火枪队）：

队长：藤堂平助。

副队长：大石锹次郎。

兵力1150。

【九番队】（忍者队）：

队长：橘舞（木下舞）。

副队长：山崎烝。

兵力400。

【十番队】（骑兵队）：

队长：原田左之助。

副队长：松原忠司。

兵力600。

【十一番队】（炮兵队）：

队长：